Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms