Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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