Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NPIPB13A6NJU9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms