Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms