Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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