Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCAF1Q9Y4C2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms