Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC4Q9UBN4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC4Q9UBN4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms