Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMC3IPQ9P2W1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMC3IPQ9P2W1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms