Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRBP1Q9P2E9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms