Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ASCL3Q9NQ33 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms