Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C20orf27Q9GZN8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms