Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSDMCQ9BYG8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms