Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CHCHD7Q9BUK0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms