Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FYCO1Q9BQS8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms