Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms