Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms