Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCOLN3Q8TDD5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms