Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ZNF439Q8NDP4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF439Q8NDP4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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