Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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