Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms