Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms