Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRMS1LQ5PSV4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRMS1LQ5PSV4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms