Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms