Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP7Q16576 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 528.6 ms