Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED1Q15648 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED1Q15648 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms