Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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