Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBX1Q14549 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.9 ms