Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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