Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPAQ06546 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms