Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF8Q02556 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms