Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BEX3Q00994 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms