Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UFM1P61960 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms