Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HADHBP55084 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HADHBP55084 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms