Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2A2P52657 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2A2P52657 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms