Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRCA2P51587 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms