Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms