Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZEB1P37275 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms