Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT1P26358 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms