Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
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