Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FGFR3P22607 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FGFR3P22607 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms