Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms