Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP2AP11388 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP2AP11388 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms