Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRPRAP08240 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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