Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms