Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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HOXA2O43364 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA2O43364 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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