Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRTO14522 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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