Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM35Q9UPQ4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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