Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms