Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM30AQ9NV96 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms