Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms